Papers — приложение, предназначенное прежде всего для ученых, нуждающихся в удобном инструменте организации текстов научных статей. Пользователи Papers могут заносить в базу данных приложения документы в формате PDF, которые будут упорядочены и представлены в удобном интерфейсе в стиле iTunes, разбитые на категории по годам, рейтингу, последнему времени прочтения и т.д. Новые статьи можно загружать из Web-сервиса PubMed. Имеется возможность печати, также документы можно просматривать непосредственно из самой программы, в основном окне или в полноэкранном режиме.
Новая версия, согласно разработчикам, включила много изменений. Был переписан файловый движок, добавлена встроенная поддержка плагинов. Теперь пользователи могут задавать шаблоны имен файлов, указывать расположение библиотеки на жестком диске, использовать Web-функции, такие, как поиск в PubMed, через прокси-сервер. Также был внесен ряд исправлений.